Разработчик ЗРК, изобретатель. Доктор технических наук, профессор. Заслуженный деятель науки РФ (1997). После окончания в 1959 г. Московского энергетического института работал в КБ-1 (НПО «Алмаз», ГСКБ «Алмаз-Антей»). Прошёл путь от инженера до главного конструктора. Принимал участие в разработке, испытаниях, оценке характеристик зенитных систем С-25, С-75, С-125, С-200, С-300П. Руководил разработкой технологии комплексного проектирования многомерных нелинейных нестационарных систем управления. Автор более 100 научных трудов, имеет 22 свидетельства на изобретения. Лауреат Ленинской премии (1980), премии имени А.А. Расплетина РАН (2001). Награждён двумя орденами Трудового Красного Знамени, тремя медалями.
     Скончался Ю.В. Афонин 31 мая 2005 года, похоронен в Москве, в закрытом колумбарии Ваганьковского кладбища.