Живописец, акварелист, график, книжный иллюстратор, плакатист, педагог, профессор живописи. Заслуженный художник РСФСР. В 1909-1920 гг. учился (с перерывами) в Одесском художественном училище имени Великого Князя Владимира Александровича. Был членом одесского художественного объединения.
В 1919 г. занимался организацией в Одессе студий ИЗО для рабочих и красноармейцев, а в 1920 году возглавил мастерскую ЮгРОСТА по изготовлению агитационных плакатов. С 1921 г. жил в Москве. Принимал участие в работе обществ "Бытие" (1923-1927), "Жизнь-творчество" (1924) и ОСТ (1927). В 1930-е годы преподавал в Московской средней художественной школе (МСХШ), совместно с женой
Надеждой Субботиной, совершил несколько творческих командировок. В годы Великой Отечественной войны - работал в "Окнах ТАСС". В 1944-1950 гг. - преподавал в Московском художественном училище Памяти 1905 г. Участник выставок.
Работы художника находятся в Третьяковской галерее, Государственном Русском музее, Центральном музее Вооруженных сил РФ, в МОСХе, Пензенской картинной галерее, музеях Казани, Саратова, картинной галерее "Московская палитра" и в других музеях.
К сожалению, М.С. Перуцкий, в своё время очень популярный, после смерти (23 января 1959 г.) был очень быстро забыт.
Похоронен в Москве на Донском кладбище (Новая территория Донского монастыря), рядом с супругой.