Учёный-биолог, доцент лаборатории развития биологического факультета МГУ, в 1938-1948 гг. - декан факультета. Профессор. В годы Великой Отечественной войны: в 1941-1943 г. занимался организацией эвакуакии биологического факультета, возглавлял противовоздушную оборону и охрану университета;
с августа 1942 г. по январь 1943 г. - исполнял обязанности ректора МГУ. Автор многих научных трудов. Открыто защищал труды советских генетиков,
несмотря на то, что эта наука находилась в те времена под запретом. В 1947 г. был вынужден уйти из МГУ. Последние 10 лет жизни занимался изучением новых препаратов против рака. Создал институт по изысканию антибиотиков Академии Медицинских наук СССР.
Скончался С.Д. Юдинцев в 1960 году, похоронен в Москве на Ваганьковском кладбище (25 уч.).